Sindirim sisteminin içi mukoza adı verilen bir zar ile döşenmiştir. Ülser bu mukoza tabasında meydana gelen yaraya denir. Ülserin diğer yaralardan farkı, iyileşmesinin daha uzun sürmesidir. Mideden sonra ince bağırsak başlar ve ince bağırsağın ilk bölümünü oniki parmak barsağı da denilen duedonum oluşturur. Peptik ülser mide ya da duedonum ülseridir. İkisi birlikte olabilir ya da sadece biri görülebilir. Mide ülserine gastrik ülser de denir. Ülserin en sık nedeni Helicobacter pylori adı verilen bir bakteri enfeksiyonudur. Bu bakteriyi öldüren antibiyotiklerin kullanımı ile ülserde iyileşme görülebilmektedir. İbuprofen gibi nonsteroid anti-inflamatuar ilaçlar (ağrı kesici) da ülserlerin yaygın bir nedenidir. Ülser kanayabilir ve bu yaşamı tehdit edecek boyutta olabilir. Yine ülser derinleşerek mide ya da bağırsak duvarında delinmeye neden olabilir (ülser perforasyonu). Ülserin delinmesi karın zarı iltihabına (peritonit) neden olabilir. Nadiren sindirim kanalının bazı bölümlerindeki bir ülser kansere dönüşebilir.
